Julien Cohen-Adad
Phd (Paris/Montreal), MSc (Rennes), Eng (Paris)
Professeur agrégé
Département de génie électrique
Département de génie électrique
Projet(s) de recherche pour étudiants
Intérêts de recherche et affiliations
Intérêts de recherche
Mon laboratoire développe des méthodes de pointe en Imagerie par Résonance Magnétique (IRM) pour évaluer la structure et la fonction du cerveau et de la moelle épinière. Les projets impliquent des développements méthodologiques tels que construction d'antennes, traitement d'image (correction de mouvement, segmentation, recalage multimodal). Un fort accent est mis sur la l'application clinique des développements, visant à améliorer le diagnostic et le pronostic chez les patients atteints de maladies neurodégénératives et traumatismes.
L'environnement du laboratoire est très multi-disciplinaire. Nous interagissons régulièrement avec des physiciens, ingénieurs, radiologues, neurologues et neurophysiologistes. En plus, notre laboratoire collabore avec le Martinos Center for Biomedical Imaging (Harvard), par conséquent certains projets impliqueront des déplacements à Boston. Les projets comprennent:
- IRM de la moelle épinière chez des patients atteints de sclérose en plaques (collaboration avec Harvard),
- Etudier des caractéristiques du cerveau par IRM à ultra-haut champ (collaboration avec Harvard),
- Développement de méthodes basées deep learning pour analyser les images médicales (collaboration avec Mila),
- Développement de logiciels open-source d'analyses d'images médicales
- Construction d'antennes IRM
Affiliation(s)
- Chaire de recherche du Canada de niveau 2 en imagerie par résonance magnétique quantitative, Titulaire
- Unité de neuroimagerie fonctionnelle (UNF), Co-directeur
- Laboratoire de Recherche en Neuroimagerie (NeuroPoly), Co-directeur
- Centre de recherche de l'Institut universitaire de gériatrie de Montréal (CRIUGM), Chercheur
- Département de neurosciences, Université de Montréal, Professeur associé
- Institut de valorisation des données (IVADO), Membre
- Centre de recherche en sciences et technologies biomédicales (GRSTB), Membre
- Institut de génie biomédical, Membre
- Réseau de bio-imagerie du Québec (RBIQ), Membre
- Centre de recherche avancée en micro-ondes et en électronique spatiale (POLY-GRAMES), Membre
- Mila - Quebec AI Institute, Montreal, QC, Canada, Membre associé
Type(s) d'expertises (sujets CRSNG)
- 1900 GÉNIE BIOMÉDICAL
- 1901 Technologie biomédicale
- 3102 Physique nucléaire
- 6400 RECHERCHE EN SCIENCES DE LA VIE LIÉES À LA SANTÉ PUBLIQUE ET AUX MALADIES HUMAINES
- 9000 SCIENCES MÉDICALES
Publications
Publications récentes
Communication de conférence
Communication de conférence
Communication de conférence
Article de revue
Le Troter, A., Laines Medina, N. J., Mchinda, S., Cohen-Adad, J., & Callot, V. (juin 2023). AMU7T : a 3D qT1 and T2*w high-resolution in vivo template with refined white and gray matter parcellation dedicated to 7T spinal cord MR analyses [Présentation]. Dans ISMRM & ISMRT annual Meeting & Exhibition, Toronto, ON, Canada.
Bédard, S., El Baz, A., Macar, U., & Cohen-Adad, J. (juin 2023). Contrast-agnostic segmentation of the spinal cord using deep learning [Présentation]. Dans ISMRM & ISMRT annual Meeting & Exhibition, Toronto, ON, Canada.
Bédard, S., El Baz, A., Macar, U., Bouchard, L.-F., & Cohen-Adad, J. (juillet 2023). Contrast-agnostic segmentation of the spinal cord : validation in a multi-center cohort [Affiche]. OHBM 2023, Montreal, Qc, Canada.
Alonso Ortiz, E., Papp, D., D'Astous, A., & Cohen-Adad, J. (2023). Dynamic shimming in the cervical spinal cord for multi-echo gradient-echo imaging at 3 T. Neuroimage: Reports, 3(1), 100150.
Biographie
Prof. Cohen-Adad is an MR physicist and software developer with over 15 years of experience in advanced MRI methods for quantitative assessment of the brain and spinal cord structure and function. He is an associate professor at Polytechnique Montreal, adjunct professor of neuroscience at the University of Montreal, associate director of the Neuroimaging Functional Unit (Univ. Montreal), member of Mila (Univ. Montreal) and he holds the Canada Research Chair in Quantitative Magnetic Resonance Imaging. Along with his colleague Prof. Nikola Stikov, he is directing the NeuroPoly Lab (www.neuro.polymtl.ca), which includes about 20 graduate students and research associates. Prof. Cohen-Adad's research is highly cited (Google Scholar). As a leader in the field, he organized multiple workshops at international conferences (https://spinalcordmri.org/workshops.html). He is a frequent guest lecturer on advanced MRI methods and he regularly serves as consultant for various companies (e.g. Biospective Inc., NeuroRx, IMEKA) and academic (Harvard, U. Toronto, UCL, UCSF, etc.) for setting up MRI acquisition and image processing protocols.
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Enseignement
- GBM6125
- GBM6904/7904
- GBM8378
Encadrement à Polytechnique
TERMINÉ
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Thèse de doctorat (6)
- Enguix Chiral, V. (2022). Neonatal Resting-State Functional Magnetic Resonance Imaging: Optimization of Data Acquisition and Democratization of Data Preprocessing [Thèse de doctorat, Polytechnique Montréal].
- Mangeat, G. (2021). Development of in-Vivo Histology with Quantitative Magnetic Resonance Imaging to Resolve Fine Neurodegenerative Features [Thèse de doctorat, Polytechnique Montréal].
- Topfer, R. (2021). Local Coils and Prospective Shimming for MRI of the Spinal Cord [Thèse de doctorat, Polytechnique Montréal].
- De Leener, B. (2017). Development of an MRI Template and Analysis Pipeline for the Spinal Cord and Application in Patients with Spinal Cord Injury [Thèse de doctorat, École Polytechnique de Montréal].
- Duval, T. (2017). Quantification de la microstructure de la moelle épinière humaine par IRM et application chez des patients avec sclérose en plaques [Thèse de doctorat, École Polytechnique de Montréal].
- Lopez Rios, N. (2017). Development of a New Multi-Channel MRI Coil Optimized for Brain Studies in Human Neonates [Thèse de doctorat, École Polytechnique de Montréal].
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Mémoire de maîtrise (17)
- Bourget, M.-H. (2022). Écosystème logiciel de segmentation de neurones sur des images microscopiques par apprentissage profond [Mémoire de maîtrise, Polytechnique Montréal].
- Cereza, G. (2022). Development of an Innovative Solution Minimizing RF Field Inhomogeneity and Energy Deposition in Ultra-High Field MRI Applications [Mémoire de maîtrise, Polytechnique Montréal].
- D'Astous, A. (2022). Shimming Toolbox: An Open-Source Software Package for Shimming the B0 and B1 Field in Magnetic Resonance Imaging [Mémoire de maîtrise, Polytechnique Montréal].
- Lemay, A. (2022). Impact of Soft Segmentation Training on Medical Image Segmentation and Uncertainty Representation [Mémoire de maîtrise, Polytechnique Montréal].
- Vincent, O. (2021). Impact of Rater Style on Deep Learning Segmentation in Medical Imaging [Mémoire de maîtrise, Polytechnique Montréal].
- Rouhier, L. (2020). Prognosis for Degenerative Cervical Myelopathy: A Computer Learning Approach on the AOspine Database [Mémoire de maîtrise, Polytechnique Montréal].
- Nami, H. (2019). Clustering of the White Matter Tracts in the Rat Spinal Cord Based on Quantitative Histology [Mémoire de maîtrise, Polytechnique Montréal].
- Samuel Perone, C. (2019). Deep Learning Methods for MRI Spinal Cord Gray Matter Segmentation [Mémoire de maîtrise, Polytechnique Montréal].
- Gros, C. (2018). Automatic Segmentation of Intramedullary Multiple Sclerosis Lesions [Mémoire de maîtrise, École Polytechnique de Montréal].
- Zaimi, A. (2018). Automatic Axon and Myelin Segmentation of Microscopy Images and Morphometrics Extraction [Mémoire de maîtrise, École Polytechnique de Montréal].
- Germain, G. (2017). Une antenne hybride RF/shimming pour l'IRM de la moelle épinière [Mémoire de maîtrise, École Polytechnique de Montréal].
- Saliani, A. (2017). Construction d'un atlas de la microstructure de la matière blanche de la moelle épinière chez le rat à partir d'acquisitions histologiques [Mémoire de maîtrise, École Polytechnique de Montréal].
- Vuong, M. T. (2017). Comparison of Myelin Imaging Techniques in Ex Vivo Spinal Cord [Mémoire de maîtrise, École Polytechnique de Montréal].
- Lévy, S. (2016). Caractérisation de la microstructure des voies spinales humaines par IRM multiparamétrique [Mémoire de maîtrise, École Polytechnique de Montréal].
- Mangeat, G. (2016). Study of Human Cortical Microstructure Using Magnetization Transfer and T2* Mapping with Application in Multiple Sclerosis [Mémoire de maîtrise, École Polytechnique de Montréal].
- Foias, A. (2015). Design and Construction of a Highly Sensitive Coil for MRI of the Spinal Cord [Mémoire de maîtrise, École Polytechnique de Montréal].
- De Leener, B. (2014). Segmentation automatique de la moelle épinière sur des images de résonance magnétique par propagation de modèles déformables [Mémoire de maîtrise, École Polytechnique de Montréal].
Nouvelle(s) concernant Julien Cohen-Adad
NOUVELLES
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10 février 2022
Un appui du Québec et de l'Allemagne pour le développement d’un outil d’IA ciblant la sclérose en plaques |
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NOUVELLES
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6 janvier 2022
Découverte «Québec Science» de l’année 2021: les professeurs Cohen-Adad et Gervais et leurs équipes parmi les finalistes |
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NOUVELLES
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22 juin 2021
Programme des chaires de recherche du Canada : renouvellement d’une chaire détenue par le professeur Julien Cohen-Adad à Polytechnique Montréal |
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NOUVELLES
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22 juin 2021
Sciences humaines : des chercheuses et des chercheurs de Polytechnique Montréal impliqués dans des projets et partenariats de recherche |
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NOUVELLES
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29 avril 2021
Polytechnique Montréal récompense la meilleure thèse et le meilleur mémoire de l’année 2020 |
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NOUVELLES
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24 février 2021
50 scientifiques de Polytechnique Montréal parmi le top 2 % des plus cités dans leur champ de recherche |
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NOUVELLES
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22 janvier 2018
Concours de projets 2017 de l’Institut TransMedTech : du soutien pour les projets de professeurs et d’étudiants chercheurs de Polytechnique Montréal |
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NOUVELLES
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12 février 2016
Polytechnique reçoit 7,5 M$ pour six chaires dans le cadre du Programme des chaires de recherche du Canada |
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NOUVELLES
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21 juillet 2015
Un chercheur de Polytechnique récipiendaire d'une subvention du nouveau volet Fondation des IRSC |
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Revue de presse concernant Julien Cohen-Adad
23 janvier 2022,
Québec Science,
Un nouveau protocole qui promet de changer le monde médical
Une équipe de 92 personnes, menée par le Pr Julien Cohen-Adad du Département de génie électrique de Polytechnique Montréal, a mis au point un protocole permettant de créer des images par résonance magnétique de la moelle épinière plus claires et plus justes qu’auparavant.
1 janvier 2022,
Québec Science,
Moelle épinière : nouveau souffle pour les IRM
Jusqu’à tout récemment, les images de la moelle épinière obtenues par résonance magnétique n’étaient pas standardisées, ce qui empêchait de les comparer et de suivre l’évolution des lésions. C’est maintenant réglé grâce à une avancée du Pr Julien Cohen-Adad du Département de génie électrique sélectionnée parmi les 10 Découvertes de l’année par le magazine Québec Science.
8 février 2016,
Le Devoir,
Les capacités d'apprentissage du système nerveux
Image obtenue par résonance magnétique des faisceaux de fibres nerveuses (ou axones) qui descendent dans la moelle épinière et dont les corps cellulaires sont situés dans le cortex cérébral. ( Photo: Laboratoire du professeur Julien Cohen-Adad, École Polytechnique de Montréal).
