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Intérêts de recherche et affiliations

Intérêts de recherche

Mes intérêts de recherche portent sur le développement de nouvelles technologies en neuroimagerie pédiatrique, avec un intérêt particulier sur les outils d'analyse d'images open-source du cerveau et de la moelle épinière acquises par résonance magnétique, en utilisant des approches avancées de segmentation et de recalage d'image, de template et d'atlas neurodéveloppementaux et d'apprentissage machine. Le laboratoire est intimement lié à l'Institut TransMedTech et le Centre de Recherche du CHU Sainte-Justine, offrant des collaborations importantes entre chercheurs, ingénieurs, psychologue, radiologues et médecins.

  • Imagerie médicale
  • Vision par ordinateur
  • Neuroimagerie pédiatrique
  • Traitement et analyse d'images
  • Apprentissage machine
  • Modélisation
Type(s) d'expertises (sujets CRSNG)
  • 1901 Technologie biomédicale
  • 2603 Vision artificielle
  • 2605 Analyse de formes et intelligence artificielle
  • 2604 Applications de systèmes intelligents
  • 2708 Traitement d'images et traitement vidéo

Publications

Publications récentes
Article de revue
Gros, C., De Leener, B., Badji, A., Maranzano, J., Eden, D., Dupont, S.M., Talbott, J., Zhuoquiong, R., Liu, Y., Granberg, T., Ouellette, R., Tachibana, Y., Hori, M., Kamiya, K., Chougar, L., Stawiarz, L., Hillert, J., Bannier, E., Kerbrat, A., Edan, G., Labauge, P., Callot, V., Pelletier, J., Audoin, B., Rasoanandrianina, H., Brisset, J.-C., Valsasina, P., Rocca, M.A., Filippi, M., Bakshi, R., Tauhid, S., Prados, F., Yiannakas, M., Kearney, H., Ciccarelli, O., Smith, S., Treaba, C.A., Mainero, C., Lefeuvre, J., Reich, D.S., Nair, G., Auclair, V., McLaren, D.G., Martin, A.R., Fehlings, M.G., Vahdat, S., Khatibi, A., Doyon, J., Shepherd, T., Charlson, E., Narayanan, S. & Cohen-Adad, J. (2019). Automatic segmentation of the spinal cord and intramedullary multiple sclerosis lesions with convolutional neural networks. NeuroImage, 184, 901-915. Tiré de https://doi.org/10.1016/j.neuroimage.2018.09.081
Communication de conférence
Shahrampour, S., De Leener, B., Middleton, D., Jonnavithula, K., Alizadeh, M., Pediyakkal, H., Krisa, L., Flanders, A., Faro, S., Cohen-Adad, J. & Mohamed, F. (2019). Development of a standardized normative pediatric spinal cord structural template : demonstration of an automatic estimation of spinal cord cross sectional area measurements (SCCSA). Communication présentée à ISMRM 27th Annual Meeting & Exhibition, Montreal, Qc.
Article de revue
Eden, D., Gros, C., Badji, A., Dupont, S.M., De Leener, B., Maranzano, J., Zhuoquiong, R., Liu, Y., Granberg, T., Ouellette, R., Stawiarz, L., Hillert, J., Talbott, J., Bannier, E., Kerbrat, A., Edan, G., Labauge, P., Callot, V., Pelletier, J., Audoin, B., Rasoanandrianina, H., Brisset, J.-C., Valsasina, P., Rocca, M.A., Filippi, M., Bakshi, R., Tauhid, S., Prados, F., Yiannakas, M., Kearney, H., Ciccarelli, O., Smith, S.A., Andrada Treaba, C., Mainero, C., Lefeuvre, J., Reich, D.S., Nair, G., Shepherd, T.M., Charlson, E., Tachibana, Y., Hori, M., Kamiya, K., Chougar, L., Narayanan, S. & Cohen-Adad, J. (2019). Spatial distribution of multiple sclerosis lesions in the cervical spinal cord. Brain, 142, 633-646. Tiré de https://doi.org/10.1093/brain/awy352
Article de revue
Gros, C., De Leener, B., Dupont, S.M., Martin, A.R., Fehlings, M.G., Bakshi, R., Tummala, S., Auclair, V., McLaren, D.G., Callot, V., Cohen-Adad, J. & Sdika, M. (2018). Automatic spinal cord localization, robust to MRI contrasts using global curve optimization. Medical Image Analysis, 44, 215-227. Tiré de https://doi.org/10.1016/j.media.2017.12.001

Enseignement

INF1005D – Programmation procédurale en Python

Formation

  • Doctorat en génie biomédical, Polytechnique Montréal, Canada
  • Maîtrise en génie biomédical, Polytechnique Montréal, Canada
  • Master en ingénieur civil biomédical, Université Libre de Bruxelles, Belgique
  • Bachelier en ingénierie civil, Université Libre de Bruxelles, Belgique