Répertoire des expertises
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Intérêts de recherche et affiliations

Intérêts de recherche

Mes intérêts de recherche portent sur le développement de nouvelles technologies en neuroimagerie pédiatrique, avec un intérêt particulier sur les outils d'analyse d'images open-source du cerveau et de la moelle épinière acquises par résonance magnétique, en utilisant des approches avancées de segmentation et de recalage d'image, de template et d'atlas neurodéveloppementaux et d'apprentissage machine. Le laboratoire est intimement lié à l'Institut TransMedTech et le Centre de Recherche du CHU Sainte-Justine, offrant des collaborations importantes entre chercheurs, ingénieurs, psychologue, radiologues et médecins.

  • Imagerie médicale
  • Vision par ordinateur
  • Neuroimagerie pédiatrique
  • Traitement et analyse d'images
  • Apprentissage machine
  • Modélisation
Type(s) d'expertises (sujets CRSNG)
  • 1901 Technologie biomédicale
  • 2603 Vision artificielle
  • 2605 Analyse de formes et intelligence artificielle
  • 2604 Applications de systèmes intelligents
  • 2708 Traitement d'images et traitement vidéo

Publications

Publications récentes
Article de revue
Mangeat, G., Ouellette, R., Wabartha, M., De Leener, B., Platten, M., Karrenbauer, V.D., Warntjes, M., Stikov, N., Mainero, C., Cohen-Adad, J. & Granberg, T. (2020). Machine Learning and Multiparametric Brain MRI to Differentiate Hereditary Diffuse Leukodystrophy with Spheroids from Multiple Sclerosis. Journal of Neuroimaging, 30(5), 674-682. Tiré de https://doi.org/10.1111/jon.12725
Article de revue
Ouellette, R., Treaba, C.A., Granberg, T., Herranz, E., Barletta, V., Mehndiratta, A., De Leener, B., Tauhid, S., Yousuf, F., Dupont, S.M., Klawiter, E.C., Sloane, J.A., Bakshi, R., Cohen-Adad, J. & Mainero, C. (2020). 7 T imaging reveals a gradient in spinal cord lesion distribution in multiple sclerosis. Brain, 143, 2973-2987. Tiré de https://doi.org/10.1093/brain/awaa249
Article de revue
Gros, C., De Leener, B., Badji, A., Maranzano, J., Eden, D., Dupont, S.M., Talbott, J., Zhuoquiong, R., Liu, Y., Granberg, T., Ouellette, R., Tachibana, Y., Hori, M., Kamiya, K., Chougar, L., Stawiarz, L., Hillert, J., Bannier, E., Kerbrat, A., Edan, G., Labauge, P., Callot, V., Pelletier, J., Audoin, B., Rasoanandrianina, H., Brisset, J.-C., Valsasina, P., Rocca, M.A., Filippi, M., Bakshi, R., Tauhid, S., Prados, F., Yiannakas, M., Kearney, H., Ciccarelli, O., Smith, S., Treaba, C.A., Mainero, C., Lefeuvre, J., Reich, D.S., Nair, G., Auclair, V., McLaren, D.G., Martin, A.R., Fehlings, M.G., Vahdat, S., Khatibi, A., Doyon, J., Shepherd, T., Charlson, E., Narayanan, S. & Cohen-Adad, J. (2019). Automatic segmentation of the spinal cord and intramedullary multiple sclerosis lesions with convolutional neural networks. NeuroImage, 184, 901-915. Tiré de https://doi.org/10.1016/j.neuroimage.2018.09.081
Communication de conférence
Ouellette, R., Treaba, C.A., Granberg, T., Herranz, E., Barletta, V., Mehndiratta, A., De Leener, B., Tauhid, S., Yousuf, F., Dupont, S., Klawiter, E.C., Sloane, J.A., Bakshi, R., Cohen-Adad, J. & Mainero, C. (2019). Characterization of outer and inner spinal cord pathology in multiple sclerosis by 7 Tesla imaging [Résumé]. Communication présentée à 35th Congress of the European-Committee-for-Treatment-and-Research-in-Multiple-Sclerosis (ECTRIMS) and 24th Annual Conference of Rehabilitation in MS, Stockholm, Sweden. (Publié dans Multiple Sclerosis Journal, 25, 681-682). Tiré de https://doi.org/10.1177/1352458519868081

Enseignement

INF1005D – Programmation procédurale en Python

INF1007 - Introduction à la programmation

GBM8770 - Traitement numérique d'images médicales

Formation

  • Doctorat en génie biomédical, Polytechnique Montréal, Canada
  • Maîtrise en génie biomédical, Polytechnique Montréal, Canada
  • Master en ingénieur civil biomédical, Université Libre de Bruxelles, Belgique
  • Bachelier en ingénierie civil, Université Libre de Bruxelles, Belgique

Encadrement à Polytechnique

EN COURS

  • Doctorat (1)

    • Zhang, Erjun. Développement d'un modèle IRM de diffusion pour la quantification de l'impact de l'hypoglycémie sur le cerveau de bébés prématurés.
  • Maîtrise recherche (2)

    • Blanc, Colline. Développement d’un pipeline automatisé d’analyse d’images de la moelle épinière chez les enfants.
    • Ridani, Daniel. Développement d’un algorithme de reconstruction d’images IRM néonatal par imagerie QSM.

Revue de presse concernant Benjamin De Leener

1 mars 2021, La Presse, ChrysaLabs : du génie biomédical aux sondes d’analyse du sol Gabriel Mangeat, étudiant au doctorat en génie biomédical, et Benjamin De Leener, professeur adjoint au Département de génie informatique et génie logiciel, tous deux à Polytechnique Montréal, qui ont fondé ChrysaLabs, parlent de la mise en marché d'une sonde portative pour analyser le sol en temps réel.  
10 mars 2020, McGill, Neural Pathways: Dr. Benjamin De Leener Article sur Benjamin De Leener, professeur adjoint au Département de génie informatique et génie logiciel de Polytechnique Montréal et titulaire de la chaire de recherche TransMedTech.