Farida Cheriet
Ing. (Algérie), D.E.A. (France), Ph.D. (Montréal)
Full Professor
Department of Computer Engineering and Software Engineering
Department of Computer Engineering and Software Engineering
Research interests and affiliations
Research interests
- Artificial vision
- Medical imaging
- Design of anatomic structures
- Merger of multimodal images
- Estimation of 3D movement
- Learning techniques
Affiliation(s)
Expertise type(s) (NSERC subjects)
- 1901 Biomedical technology
- 2800 ARTIFICIAL INTELLIGENCE (Computer Vision, use 2603)
Publications
Recent publications
Journal article
Conference paper
Journal article
Journal article
Alsheghri, A., Ladini, Y., Hosseinimanesh, G., Cheriet, F., Chafi, I., Guibault, F., & Kerem, J. (2024). Adaptive point learning with uncertainty quantification to generate margin lines on prepared teeth. Applied Sciences, 14(20), 9486 (21 pages).
Playout, C., Legault, Z., Duval, R., Boucher, M. C., & Cheriet, F. (2024, October). A Region-Based Approach to Diabetic Retinopathy Classification with Superpixel Tokenization [Paper]. Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI 2024), Marrakesh, Morocco.
Desrosiers, C., Letenneur, M., Bernier, F., Piché, N., Provencher, B., Cheriet, F., Guibault, F., & Brailovski, V. (2024). Automated porosity segmentation in laser powder bed fusion part using computed tomography: a validity study. Journal of Intelligent Manufacturing, 21 pages.
Khani, M., Debanné, P., Guibault, F., Labelle, H., Parent, S., & Cheriet, F. (2024). Automatic assessment of scoliosis surgery outcome on trunk shape using left–right trunk asymmetry. European Spine Journal, 9 pages.
See all publications (246)
Teaching
Réseaux de communications numériques. Infographie et interfaces personne-machine.
Supervision at Polytechnique
COMPLETED
-
Ph.D. Thesis (28)
- Khani, M. (2023). Automatic Analysis of the Scoliotic Trunk for Surgery Planning and Outcome Assessment [Ph.D. thesis, Polytechnique Montréal].
- Playout, C. (2023). Modélisation interprétable du diagnostic de pathologies rétiniennes par apprentissage profond [Ph.D. thesis, Polytechnique Montréal].
- Yahyatabar Arabi, M. E. (2023). Interpretable Learning Models for Acute Respiratory Distress Syndrome Detection from Chest Radiographs [Ph.D. thesis, Polytechnique Montréal].
- Tran, D. H. (2022). Deep Learning Model Generalization for Microscopy Image Analysis [Ph.D. thesis, Polytechnique Montréal].
- Damseh, R. (2020). Anatomical Modeling of Cerebral Microvascular Structures: Application to Identify Biomarkers of Microstrokes [Ph.D. thesis, Polytechnique Montréal].
- Begdouri, A.-H. (2019). Comportement mécanique du tissu cardiaque par flux optique et méthode des champs virtuels [Ph.D. thesis, Polytechnique Montréal].
- Girard, F. (2018). Modélisation statistique des structures anatomiques de la rétine à partir d'images de fond d'oeil [Ph.D. thesis, École Polytechnique de Montréal].
- Moheb Pour, M. R. (2018). Automatic Mesh-Based Segmentation of Multiple Organs in MR Images [Ph.D. thesis, École Polytechnique de Montréal].
- Béliveau, P. (2017). Texture Analysis of Late Gadolinium Enhanced Cardiac Magnetic Resonance Images for Characterizing Myocardial Fibrosis and Infarction [Ph.D. thesis, École Polytechnique de Montréal].
- Bendaoudi, H. (2017). Flexible Hardware Architectures for Retinal Image Analysis [Ph.D. thesis, École Polytechnique de Montréal].
- Christodoulidis, A. (2017). Segmentation and Characterization of Small Retinal Vessels in Fundus Images Using the Tensor Voting Approach [Ph.D. thesis, École Polytechnique de Montréal].
- Piché, N. (2017). Un nouveau descripteur iconique topologique pour l'appariement d'images de structures anatomiques [Ph.D. thesis, École Polytechnique de Montréal].
- Zaglam, N. (2017). Analyse automatique de radiographies pulmonaires pour le diagnostic précoce du syndrome de détresse respiratoire aiguë [Ph.D. thesis, École Polytechnique de Montréal].
- Aissiou, M. (2016). Early Detection of Doxorubicin-Induced Cardiotoxicity Using Combined Biomechanical Modeling and Multi-Parametric Cardiovascular MRI [Ph.D. thesis, École Polytechnique de Montréal].
- Benovoy, M. (2016). Automatic Spatiotemporal Analysis of Cardiac Image Series [Ph.D. thesis, École Polytechnique de Montréal].
- Courchesne, O. (2016). Modélisation géométrique 3D des structures anatomiques du tronc humain à partir d'images acquises par résonnance magnétique [Ph.D. thesis, École Polytechnique de Montréal].
- Olamaei, N. (2015). 3D Visualization of Microvascular Networks Using Magnetic Particles: Application to Magnetic Resonance Navigation [Ph.D. thesis, École Polytechnique de Montréal].
- Assi, K. C. (2014). Modélisation physique des tissus mous du tronc scoliotique pour la simulation de l'apparence post-chirurgicale [Ph.D. thesis, École Polytechnique de Montréal].
- Harmouche, R. (2012). Fusion multimodale d'images pour la reconstruction et la modélisation géométrique 3D du tronc humain [Ph.D. thesis, École Polytechnique de Montréal].
- Lombaert, H. (2012). Atlas Construction for Measuring the Variability of Complex Anatomical Structures [Ph.D. thesis, École Polytechnique de Montréal].
- Séoud, L. (2012). Analyse de la relation entre les déformations scoliotiques du tronc et celles des structures osseuses sous-jacentes [Ph.D. thesis, École Polytechnique de Montréal].
- Chevrefils, C. (2010). Construction d'un modèle per-opératoire 3D du rachis pour la navigation en thoracoscopie. [Ph.D. thesis, École Polytechnique de Montréal].
- Boisvert, J. (2008). Modèles de la variabilité géométrique du rachis scoliotique [Ph.D. thesis, École Polytechnique de Montréal].
- Fallavollita, P. (2008). 3D reconstruction of coronary arteries from angiographic sequences for interventional assistance [Ph.D. thesis, École Polytechnique de Montréal].
- Hurtut, T. (2008). Analyse et recherche d'oeuvres d'art 2D selon le contenu pictural [Ph.D. thesis, École Polytechnique de Montréal].
- Kadoury, S. (2008). Reconstruction 3D personnalisée de la colonne vertébrale à partir d'images radiographiques non-calibrées [Ph.D. thesis, École Polytechnique de Montréal].
- Saddi, K. A. (2008). Recalage non rigide et segmentation automatique d'images de perfusion du foie [Ph.D. thesis, École Polytechnique de Montréal].
- Duong, L. (2007). Détection et classification automatique de la colonne vertébrale à partir d'images à rayons-X [Ph.D. thesis, École Polytechnique de Montréal].
- Khani, M. (2023). Automatic Analysis of the Scoliotic Trunk for Surgery Planning and Outcome Assessment [Ph.D. thesis, Polytechnique Montréal].
-
Master's Thesis (46)
- Siddhika Arunachalam, S. A. (2024). Prediction of the Postoperative Shape of the Trunk After Spinal Surgery Using Deep Learning [Master's thesis, Polytechnique Montréal].
- Lesec, C. (2022). Analyse automatique d'images histopathologiques de tissus tumoraux micro-disséqués [Master's thesis, Polytechnique Montréal].
- Lessard, O. (2022). Génération de maillage surfacique de dents par apprentissage profond [Master's thesis, Polytechnique Montréal].
- Dumas, R. (2021). Segmentation de la couche choroïdienne sur images OCT oculaires par apprentissage profond et applications [Master's thesis, Polytechnique Montréal].
- Royer-Rivard, R. (2021). Mise en correspondance spatio-temporelle de séquences angiographiques par apprentissage profond [Master's thesis, Polytechnique Montréal].
- Bélanger Nzakimuena, C. (2020). Automated Analysis of Retinal and Choroidal OCT and OCTA Images in AMD [Master's thesis, Polytechnique Montréal].
- Elkommos Daoud, Y. (2020). Évaluation de la précision de systèmes d'acquisition de la géométrie 3D du tronc pour la conception de corsets personnalisés [Master's thesis, Polytechnique Montréal].
- Peskine, Y. B. (2020). Dépistage automatique de la rétinopathie diabétique dans les images de fond d'oeil à l'aide de l'apprentissage profond [Master's thesis, Polytechnique Montréal].
- Ghesquiere, P. (2018). Segmentation automatique des images de fibres d'ADN pour la quantification du stress réplicatif [Master's thesis, École Polytechnique de Montréal].
- Lepetit-Aimon, G. (2018). Architecture complètement convolutive à champ d'activation large pour la segmentation sémantique de la vasculature rétinienne dans les images de fond d'oeil [Master's thesis, École Polytechnique de Montréal].
- Playout, C. (2018). Système d'apprentissage multitâche dédié à la segmentation des lésions sombres et claires de la rétine dans les images de fond d'oeil [Master's thesis, École Polytechnique de Montréal].
- Berton, F. (2015). Analyse automatique des images échographiques de la colonne vertébrale [Master's thesis, École Polytechnique de Montréal].
- Phan, T. V. (2015). Développement et validation d'un système automatique de classification de la dégénérescence maculaire liée à l'âge [Master's thesis, École Polytechnique de Montréal].
- Beauchemin, P.-F. (2014). Développement d'une méthode d'élastographie par résonance magnétique pour l'évaluation du disque intervertébral [Master's thesis, École Polytechnique de Montréal].
- Fasih, M. (2014). Retinal Image Quality Assessment Using Supervised Classification [Master's thesis, École Polytechnique de Montréal].
- Meurée, C. (2013). Recalage d'images du fond d'oeil pour la construction d'un atlas des structures anatomiques de la rétine [Master's thesis, École Polytechnique de Montréal].
- Chihab, N. (2012). Vers une méthode automatique de reconstruction 3D du tronc scoliotique [Master's thesis, École Polytechnique de Montréal].
- Habert, S. (2012). Reconstruction 3D des artères coronaires à partir d'images angiographiques pour la visualisation en ligne des anévrismes [Master's thesis, École Polytechnique de Montréal].
- Thivierge-Gaulin, D. (2012). Mesh-Derived Image Partition for 3D-2D Registration in Image-Guided Interventions [Master's thesis, École Polytechnique de Montréal].
- Grenier, S. (2011). Reconstruction 3D personnalisée de la cage thoracique pour l'amélioration de la simulation de l'effet de la correction du rachis sur l'apparence externe du tronc [Master's thesis, École Polytechnique de Montréal].
- Bisson, M. (2010). Système de visualisation pour l'assistance des chirurgies minimalement invasives du rachis [Master's thesis, École Polytechnique de Montréal].
- Béliveau, P. (2009). Left Ventricular Viability Maps : Fusion of Multimodal Images of Coronary Morphology and Functional Information [Master's thesis, École Polytechnique de Montréal].
- Benboujja, F. (2009). Suivi automatique d'instruments dans les séquences d'images thoracoscopiques [Master's thesis, École Polytechnique de Montréal].
- Dionne, O. (2009). Développement d'un modèle numérique simplifié du tronc pour simuler l'effet d'une chirurgie de la scoliose sur l'apparence externe d'un patient [Master's thesis, École Polytechnique de Montréal].
- Girard, F. (2009). Autocalibrage de séquences d'images thoracoscopiques [Master's thesis, École Polytechnique de Montréal].
- Alexandrescu, I. (2008). Segmentation automatique de la lumière des artères sur une séquence d'images intra vasculaires à l'ultrason (IVUS) [Master's thesis, École Polytechnique de Montréal].
- Thériault, J. (2008). Analyse automatique des déformations scoliotiques par topographie de surface [Master's thesis, École Polytechnique de Montréal].
- Courchesne, O. (2007). Génération adaptative de maillage tridimensionnel à partir d'images IRM du tronc humain [Master's thesis, École Polytechnique de Montréal].
- Miled, F. (2007). Analyse de la géométrie externe du tronc scoliotique en flexion latérale [Master's thesis, École Polytechnique de Montréal].
- Plourde, F. (2007). Détection semi-automatique des contours des côtes à partir de radiographies thoraciques postéro-antérieures de patients scoliotiques [Master's thesis, École Polytechnique de Montréal].
- Shawafaty, N. (2007). Évaluation non invasive de l'effet du traitement par corset SpineCor sur la géométrie externe du tronc [Master's thesis, École Polytechnique de Montréal].
- Gemme, S. (2006). Recalage automatique de géométries de maillages surfaciques dans un environnement spatial réel [Master's thesis, École Polytechnique de Montréal].
- Archambault, M. (2005). Modélisation paramétrique de la géométrie externe du tronc pour une analyse automatique des déformations scoliotiques [Master's thesis, École Polytechnique de Montréal].
- Bergeron, C. (2005). Modélisation de la courbure scoliotique à partir de la topographie du tronc [Master's thesis, École Polytechnique de Montréal].
- Saint-Pierre, C.-A. (2005). Détection et correction des réflexions spéculaires dans les séquences d'images thoracoscopiques [Master's thesis, École Polytechnique de Montréal].
- Shu, Y. Y. (2005). Segmentation and tracking of cavity area in thoracoscopic video sequences [Master's thesis, École Polytechnique de Montréal].
- Windisch, L. (2005). Bayesian differentiation of multi-scale line-structures for model-free instrument segmentation in thoracoscopic images [Master's thesis, École Polytechnique de Montréal].
- Zhang, R. (2005). Physical modeling of the human trunk for simulation of scoliotic surgery [Master's thesis, École Polytechnique de Montréal].
- Hétu, A. (2004). Reconstruction 3D de la surface externe du tronc humain pour le suivi non effractif des déformations scoliotiques [Master's thesis, École Polytechnique de Montréal].
- Liao, Q. H. (2004). Fusion of deformable anatomical structures of human torso [Master's thesis, École Polytechnique de Montréal].
- Hurtut, T. (2003). Segmentation automatique d'image pour le suivi des cicatrices suite à une chirurgie de la scoliose [Master's thesis, École Polytechnique de Montréal].
- Wang, L. (2003). Classification of scoliotic deformities from external surface of the trunk by using support vector machines [Master's thesis, École Polytechnique de Montréal].
- Fortin, D. (2002). Développement et évaluation clinique d'un outil de conception et d'ajustement des corsets orthopédiques pour le traitement de la scoliose [Master's thesis, École Polytechnique de Montréal].
- Novosad, J. (2002). Techniques explicites pour la reconstruction 3D de la colonne vertébrale à partir d'images radiographiques [Master's thesis, École Polytechnique de Montréal].
- Pazos, V. (2002). Développement d'un système de reconstruction 3D et d'analyse de la surface externe du tronc humain pour un suivi non invasif des déformations scoliotiques [Master's thesis, École Polytechnique de Montréal].
- Garceau, P. (2000). Modélisation du contrôle neural des muscles du tronc [Master's thesis, École Polytechnique de Montréal].
Press review about Farida Cheriet
March 15, 2021,
UdeM Nouvelles,
Un investissement majeur de la FCI pour des installations de pointe
Huit projets de recherche menés par des chercheurs de l'Université de Montréal récoltent près de 21 M$ de la Fondation canadienne pour l'innovation pour des installations de pointe, dont le projet de Farida Cheriet (professeure titulaire au Département de génie informatique et génie logiciel de Polytechnique Montréal) et de Philippe Jouvet (Faculté de médecine, Centre de recherche du CHU Sainte-Justine). L'Université de Montréal est également engagée dans 6 autres projets au Canada dont celui d'Oussama Moutanabbir (professeur titulaire au Département de génie physique de Polytechnique Montréal) et de Sjoerd Roorda (Faculté des arts et des sciences).
May 4, 2018,
Le Journal de Québec,
Nos yeux décortiqués
En collaboration avec Farida Cheriet, professeure titulaire au Département de génie informatique et génie logiciel de Polytechnique Montréal, et de Marie-Carole Boucher, de l’Université de Montréal, le Dr Constantino constitue une base de données pancanadienne qui regroupera des millions d’images d’yeux.
