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Farida Cheriet
Ing. (Algérie), D.E.A. (France), Ph.D. (Montréal)
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Full Professor
Department of Computer Engineering and Software Engineering
Phone: (514) 340-4711 Ext. 4277 Fax: (514) 340-5139 Room: M-3115
Areas of expertise
Biomedical technology Artificial intelligence

Research interests and affiliations

Research interests
  • Artificial vision
  • Medical imaging
  • Design of anatomic structures
  • Merger of multimodal images
  • Estimation of  3D movement
  • Learning techniques
Affiliation(s)
Expertise type(s) (NSERC subjects)
  • 1901 Biomedical technology
  • 2800 ARTIFICIAL INTELLIGENCE (Computer Vision, use 2603)

Publications

Recent publications
Journal article
Yahyatabar, M., Jouvet, P., Fily, D., Rambaud, J., Levy, M., Khemani, R.G. & Cheriet, F. (2023). A Web-Based Platform for the Automatic Stratification of ARDS Severity. Diagnostics, 13(5), 16 pages. Retrieved from https://doi.org/10.3390/diagnostics13050933
Conference paper
Desrosiers, C., Letenneur, M., Bernier, F., Cheriet, F., Brailovski, V., Piché, N. & Guibault, F. (2022). Correlative laser confocal microscopy study and multimmodal 2D/3D registration as ground truth for x-ray inspection of internal defects in LPBF manufacturing. Paper presented at the 11th Conference on Industrial Computed Tomography (ICT 2022), Wels, Austria.
Conference paper
Lessard, O., Guibault, F., Keren, J. & Cheriet, F. (2022). Dental Restoration using a Multi-Resolution Deep Learning Approach. Paper presented at the 2022 IEEE 19th International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI 2022), Kolkata, India (4 pages). Retrieved from https://doi.org/10.1109/ISBI52829.2022.9761622
Journal article
Playout, C., Duval, R., Boucher, M.-C. & Cheriet, F. (2022). Focused Attention in Transformers for interpretable classification of retinal images. Medical Image Analysis, 82, 13 pages. Retrieved from https://doi.org/10.1016/j.media.2022.102608
See all publications (202)

Teaching

Réseaux de communications numériques. Infographie et interfaces personne-machine.

Supervision at Polytechnique

COMPLETED

  • Ph.D. Thesis (25)

    • Tran, D.H. (2022). Deep Learning Model Generalization for Microscopy Image Analysis (Ph.D. Thesis, Polytechnique Montréal). Retrieved from https://publications.polymtl.ca/10441/
    • Damseh, R. (2020). Anatomical Modeling of Cerebral Microvascular Structures: Application to Identify Biomarkers of Microstrokes (Ph.D. Thesis, Polytechnique Montréal). Retrieved from https://publications.polymtl.ca/5393/
    • Begdouri, A.-H. (2019). Comportement mécanique du tissu cardiaque par flux optique et méthode des champs virtuels (Ph.D. Thesis, Polytechnique Montréal). Retrieved from https://publications.polymtl.ca/4166/
    • Girard, F. (2018). Modélisation statistique des structures anatomiques de la rétine à partir d'images de fond d'œil (Ph.D. Thesis, École Polytechnique de Montréal). Retrieved from https://publications.polymtl.ca/3137/
    • Moheb Pour, M.R. (2018). Automatic Mesh-Based Segmentation of Multiple Organs in MR Images (Ph.D. Thesis, École Polytechnique de Montréal). Retrieved from https://publications.polymtl.ca/3258/
    • Béliveau, P. (2017). Texture Analysis of Late Gadolinium Enhanced Cardiac Magnetic Resonance Images for Characterizing Myocardial Fibrosis and Infarction (Ph.D. Thesis, École Polytechnique de Montréal). Retrieved from https://publications.polymtl.ca/2483/
    • Bendaoudi, H. (2017). Flexible hardware architectures for retinal image analysis (Ph.D. Thesis, École Polytechnique de Montréal). Retrieved from https://publications.polymtl.ca/2518/
    • Christodoulidis, A. (2017). Segmentation and Characterization of Small Retinal Vessels in Fundus Images Using the Tensor Voting Approach (Ph.D. Thesis, École Polytechnique de Montréal). Retrieved from https://publications.polymtl.ca/2578/
    • Piché, N. (2017). Un nouveau descripteur iconique topologique pour l'appariement d'images de structures anatomiques (Ph.D. Thesis, École Polytechnique de Montréal). Retrieved from https://publications.polymtl.ca/3109/
    • Zaglam, N. (2017). Analyse automatique de radiographies pulmonaires pour le diagnostic précoce du syndrome de détresse respiratoire aiguë (Ph.D. Thesis, École Polytechnique de Montréal). Retrieved from https://publications.polymtl.ca/2479/
    • Aissiou, M. (2016). Early Detection of Doxorubicin-Induced Cardiotoxicity Using Combined Biomechanical Modeling and Multi-Parametric Cardiovascular MRI (Ph.D. Thesis, École Polytechnique de Montréal). Retrieved from https://publications.polymtl.ca/2212/
    • Benovoy, M. (2016). Automatic Spatiotemporal Analysis of Cardiac Image Series (Ph.D. Thesis, École Polytechnique de Montréal). Retrieved from https://publications.polymtl.ca/2208/
    • Courchesne, O. (2016). Modélisation géométrique 3D des structures anatomiques du tronc humain à partir d'images acquises par résonnance magnétique (Ph.D. Thesis, École Polytechnique de Montréal). Retrieved from https://publications.polymtl.ca/2414/
    • Olamaei, N. (2015). 3D Visualization of Microvascular Networks Using Magnetic Particles: Application to Magnetic Resonance Navigation (Ph.D. Thesis, École Polytechnique de Montréal). Retrieved from https://publications.polymtl.ca/1691/
    • Assi, K.C. (2014). Modélisation physique des tissus mous du tronc scoliotique pour la simulation de l'apparence post-chirurgicale (Ph.D. Thesis, École Polytechnique de Montréal). Retrieved from https://publications.polymtl.ca/1405
    • Harmouche, R. (2012). Fusion multimodale d'images pour la reconstruction et la modélisation géométrique 3D du tronc humain (Ph.D. Thesis, École Polytechnique de Montréal). Retrieved from https://publications.polymtl.ca/998
    • Lombaert, H. (2012). Atlas Construction for Measuring the Variability of Complex Anatomical Structures (Ph.D. Thesis, École Polytechnique de Montréal). Retrieved from https://publications.polymtl.ca/877
    • Séoud, L. (2012). Analyse de la relation entre les déformations scoliotiques du tronc et celles des structures osseuses sous-jacentes (Ph.D. Thesis, École Polytechnique de Montréal). Retrieved from https://publications.polymtl.ca/801
    • Chevrefils, C. (2010). Construction d'un modèle per-opératoire 3D du rachis pour la navigation en thoracoscopie (Ph.D. Thesis, École Polytechnique de Montréal). Retrieved from https://publications.polymtl.ca/322
    • Boisvert, J. (2008). Modèles de la variabilité géométrique du rachis scoliotique (Ph.D. Thesis, École Polytechnique de Montréal).
    • Fallavollita, P. (2008). 3D reconstruction of coronary arteries from angiographic sequences for interventional assistance (Ph.D. Thesis, École Polytechnique de Montréal).
    • Hurtut, T. (2008). Analyse et recherche d'oeuvres d'art 2D selon le contenu pictural (Ph.D. Thesis, École Polytechnique de Montréal).
    • Kadoury, S. (2008). Reconstruction 3D personnalisée de la colonne vertébrale à partir d'images radiographiques non-calibrées (Ph.D. Thesis, École Polytechnique de Montréal).
    • Saddi, K.A. (2008). Recalage non rigide et segmentation automatique d'images de perfusion du foie (Ph.D. Thesis, École Polytechnique de Montréal).
    • Duong, L. (2007). Détection et classification automatique de la colonne vertébrale à partir d'images à rayons-X (Ph.D. Thesis, École Polytechnique de Montréal).

  • Master's Thesis (44)

    • Lessard, O. (2022). Génération de maillage surfacique de dents par apprentissage profond (Master's Thesis, Polytechnique Montréal). Retrieved from https://publications.polymtl.ca/10424/
    • Dumas, R. (2021). Segmentation de la couche choroïdienne sur images OCT oculaires par apprentissage profond et applications (Master's Thesis, Polytechnique Montréal). Retrieved from https://publications.polymtl.ca/9124/
    • Royer-Rivard, R. (2021). Mise en correspondance spatio-temporelle de séquences angiographiques par apprentissage profond (Master's Thesis, Polytechnique Montréal). Retrieved from https://publications.polymtl.ca/5611/
    • Bélanger Nzakimuena, C. (2020). Automated Analysis of Retinal and Choroidal OCT and OCTA Images in AMD (Master's Thesis, Polytechnique Montréal). Retrieved from https://publications.polymtl.ca/5234/
    • Elkommos Daoud, Y. (2020). Évaluation de la précision de systèmes d'acquisition de la géométrie 3D du tronc pour la conception de corsets personnalisés (Master's Thesis, Polytechnique Montréal). Retrieved from https://publications.polymtl.ca/5497/
    • Peskine, Y.B. (2020). Dépistage automatique de la rétinopathie diabétique dans les images de fond d'œil à l'aide de l'apprentissage profond (Master's Thesis, Polytechnique Montréal). Retrieved from https://publications.polymtl.ca/5415/
    • Ghesquiere, P. (2018). Segmentation automatique des images de fibres d'ADN pour la quantification du stress réplicatif (Master's Thesis, École Polytechnique de Montréal). Retrieved from https://publications.polymtl.ca/3739/
    • Lepetit-Aimon, G. (2018). Architecture complètement convolutive à champ d'activation large pour la segmentation sémantique de la vasculature rétinienne dans les images de fond d'œil (Master's Thesis, École Polytechnique de Montréal). Retrieved from https://publications.polymtl.ca/3280/
    • Playout, C. (2018). Système d'apprentissage multitâche dédié à la segmentation des lésions sombres et claires de la rétine dans les images de fond d'œil (Master's Thesis, École Polytechnique de Montréal). Retrieved from https://publications.polymtl.ca/3257/
    • Berton, F. (2015). Analyse automatique des images échographiques de la colonne vertébrale (Master's Thesis, École Polytechnique de Montréal). Retrieved from https://publications.polymtl.ca/1991/
    • Phan, T.V. (2015). Développement et validation d'un système automatique de classification de la dégénérescence maculaire liée à l'âge (Master's Thesis, École Polytechnique de Montréal). Retrieved from https://publications.polymtl.ca/1790/
    • Beauchemin, P.-F. (2014). Développement d'une méthode d'élastographie par résonance magnétique pour l'évaluation du disque intervertébral (Master's Thesis, École Polytechnique de Montréal). Retrieved from https://publications.polymtl.ca/1355
    • Fasih, M. (2014). Retinal Image Quality Assessment Using Supervised Classification (Master's Thesis, École Polytechnique de Montréal). Retrieved from https://publications.polymtl.ca/1544
    • Meurée, C. (2013). Recalage d'images du fond d'oeil pour la construction d'un atlas des structures anatomiques de la rétine (Master's Thesis, École Polytechnique de Montréal). Retrieved from https://publications.polymtl.ca/1280
    • Chihab, N. (2012). Vers une méthode automatique de reconstruction 3D du tronc scoliotique (Master's Thesis, École Polytechnique de Montréal). Retrieved from https://publications.polymtl.ca/820
    • Habert, S. (2012). Reconstruction 3D des artères coronaires à partir d'images angiographiques pour la visualisation en ligne des anévrismes (Master's Thesis, École Polytechnique de Montréal). Retrieved from https://publications.polymtl.ca/976
    • Thivierge-Gaulin, D. (2012). Mesh-Derived Image Partition for 3D-2D Registration in Image-Guided Interventions (Master's Thesis, École Polytechnique de Montréal). Retrieved from https://publications.polymtl.ca/934
    • Grenier, S. (2011). Reconstruction 3D personnalisée de la cage thoracique pour l'amélioration de la simulation de l'effet de la correction du rachis sur l'apparence externe du tronc (Master's Thesis, École Polytechnique de Montréal). Retrieved from https://publications.polymtl.ca/777
    • Bisson, M. (2010). Système de visualisation pour l'assistance des chirurgies minimalement invasives du rachis (Master's Thesis, École Polytechnique de Montréal). Retrieved from https://publications.polymtl.ca/385
    • Béliveau, P. (2009). Left ventricular viability maps : fusion of multimodal images of coronary morphology and functional information (Master's Thesis, École Polytechnique de Montréal). Retrieved from https://publications.polymtl.ca/210
    • Benboujja, F. (2009). Suivi automatique d'instruments dans les séquences d'images thoracoscopiques (Master's Thesis, École Polytechnique de Montréal).
    • Dionne, O. (2009). Développement d'un modèle numérique simplifié du tronc pour simuler l'effet d'une chirurgie de la scoliose sur l'apparence externe d'un patient (Master's Thesis, École Polytechnique de Montréal). Retrieved from https://publications.polymtl.ca/228
    • Girard, F. (2009). Autocalibrage de séquences d'images thoracoscopiques (Master's Thesis, École Polytechnique de Montréal). Retrieved from https://publications.polymtl.ca/114
    • Alexandrescu, I. (2008). Segmentation automatique de la lumière des artères sur une séquence d'images intra vasculaires à l'ultrason (IVUS) (Master's Thesis, École Polytechnique de Montréal).
    • Thériault, J. (2008). Analyse automatique des déformations scoliotiques par topographie de surface (Master's Thesis, École Polytechnique de Montréal).
    • Courchesne, O. (2007). Génération adaptative de maillage tridimensionnel à partir d'images IRM du tronc humain (Master's Thesis, École Polytechnique de Montréal).
    • Miled, F. (2007). Analyse de la géométrie externe du tronc scoliotique en flexion latérale (Master's Thesis, École Polytechnique de Montréal).
    • Plourde, F. (2007). Détection semi-automatique des contours des côtes à partir de radiographies thoraciques postéro-antérieures de patients scoliotiques (Master's Thesis, École Polytechnique de Montréal).
    • Shawafaty, N. (2007). Évaluation non invasive de l'effet du traitement par corset SpineCor sur la géométrie externe du tronc (Master's Thesis, École Polytechnique de Montréal).
    • Gemme, S. (2006). Recalage automatique de géométries de maillages surfaciques dans un environnement spatial réel (Master's Thesis, École Polytechnique de Montréal).
    • Archambault, M. (2005). Modélisation paramétrique de la géométrie externe du tronc pour une analyse automatique des déformations scoliotiques (Master's Thesis, École Polytechnique de Montréal).
    • Bergeron, C. (2005). Modélisation de la courbure scoliotique à partir de la topographie du tronc (Master's Thesis, École Polytechnique de Montréal).
    • Saint-Pierre, C.-A. (2005). Détection et correction des réflexions spéculaires dans les séquences d'images thoracoscopiques (Master's Thesis, École Polytechnique de Montréal).
    • Shu, Y.Y. (2005). Segmentation and tracking of cavity area in thoracoscopic video sequences (Master's Thesis, École Polytechnique de Montréal).
    • Windisch, L. (2005). Bayesian differentiation of multi-scale line-structures for model-free instrument segmentation in thoracoscopic images (Master's Thesis, École Polytechnique de Montréal).
    • Zhang, R. (2005). Physical modeling of the human trunk for simulation of scoliotic surgery (Master's Thesis, École Polytechnique de Montréal).
    • Hétu, A. (2004). Reconstruction 3D de la surface externe du tronc humain pour le suivi non effractif des déformations scoliotiques (Master's Thesis, École Polytechnique de Montréal).
    • Liao, Q.H. (2004). Fusion of deformable anatomical structures of human-torso (Master's Thesis, École Polytechnique de Montréal).
    • Hurtut, T. (2003). Segmentation automatique d'image pour le suivi des cicatrices suite à une chirurgie de la scoliose (Master's Thesis, École Polytechnique de Montréal).
    • Wang, L. (2003). Classification of scoliotic deformities from external surface of the trunk by using support vector machines (Master's Thesis, École Polytechnique de Montréal).
    • Fortin, D. (2002). Développement et évaluation clinique d'un outil de conception et d'ajustement des corsets orthopédiques pour le traitement de la scoliose (Master's Thesis, École Polytechnique de Montréal).
    • Novosad, J. (2002). Techniques explicites pour la reconstruction 3D de la colonne vertébrale à partir d'images radiographiques (Master's Thesis, École Polytechnique de Montréal).
    • Pazos, V. (2002). Développement d'un système de reconstruction 3D et d'analyse de la surface externe du tronc humain pour un suivi non invasif des déformations scoliotiques (Master's Thesis, École Polytechnique de Montréal).
    • Garceau, P. (2000). Modélisation du contrôle neural des muscles du tronc (Master's Thesis, École Polytechnique de Montréal).

Press review about Farida Cheriet

March 15, 2021, UdeM Nouvelles, Un investissement majeur de la FCI pour des installations de pointe Huit projets de recherche menés par des chercheurs de l'Université de Montréal récoltent près de 21 M$ de la Fondation canadienne pour l'innovation pour des installations de pointe, dont le projet de Farida Cheriet (professeure titulaire au Département de génie informatique et génie logiciel de Polytechnique Montréal) et de Philippe Jouvet (Faculté de médecine, Centre de recherche du CHU Sainte-Justine). L'Université de Montréal est également engagée dans 6 autres projets au Canada dont celui d'Oussama Moutanabbir (professeur titulaire au Département de génie physique de Polytechnique Montréal) et de Sjoerd Roorda (Faculté des arts et des sciences).
May 4, 2018, Le Journal de Québec, Nos yeux décortiqués En collaboration avec Farida Cheriet, professeure titulaire au Département de génie informatique et génie logiciel de Polytechnique Montréal, et de Marie-Carole Boucher, de l’Université de Montréal, le Dr Constantino constitue une base de données pancanadienne qui regroupera des millions d’images d’yeux.