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Mario Jolicoeur
B.Sc.A., M.Sc.A., Ph.D. (Poly)

Phone: (514) 340-4711 Ext. 4525 Fax: (514) 340-4159 Room: J-3069

Research interests and affiliations

Research interests

Development and use of metabolic engineering tools for the enhancement of the reproducibility of the production of therapeutics (metabolites, proteins, antibodies, DNA et RNA) of high quality, as well as for the characterization and selection of cell lines. Study of metabolic flux regulation by the development of mathematical models that are primarily focusing on cell energetics. Design of cell culture platform for microorganisms, plant and animal cells and tissues as well as microalgae.

Expertise type(s) (NSERC subjects)
  • 1802 Biochemical engineering
  • 1900 BIOMEDICAL ENGINEERING

Publications

Recent publications
Journal article
Zhao, X., Kasbi, M., Chen, J., Peres, S. & Jolicoeur, M. (2017). A dynamic metabolic flux analysis of ABE (acetone-butanol-ethanol) fermentation by Clostridium acetobutylicum ATCC 824, with riboflavin as a by-product. Biotechnology and Bioengineering, 114(12), 2907-2919. Retrieved from https://doi.org/10.1002/bit.26393
Journal article
Goffaux, G., Hammami, I. & Jolicoeur, M. (2017). A Dynamic Metabolic Flux Analysis of Myeloid-Derived Suppressor Cells Confirms Immunosuppression-Related Metabolic Plasticity. Scientific Reports, 7, 14 pages. Retrieved from https://doi.org/10.1038/s41598-017-10464-1
Journal article
Ren, X.J., Zhao, X.H., Turcotte, F., Deschenes, J.S., Tremblay, R. & Jolicoeur, M. (2017). Current lipid extraction methods are significantly enhanced adding a water treatment step in Chlorella protothecoides. Microbial Cell Factories, 16, 13 pages. Retrieved from https://doi.org/10.1186/s12934-017-0633-9
Journal article
Peres, S., Jolicœur, M., Moulin, C., Dague, P. & Schuster, S. (2017). How important is thermodynamics for identifying elementary flux modes? Plos One, 12(2), 20 pages. Retrieved from https://doi.org/10.1371/journal.pone.0171440

Teaching

Génie biochimique. Validation de procédés propres pour ingénieur. Chimie pour ingénieur. Culture de cellules. Ingénierie des biosystèmes.

Supervision at Polytechnique

IN PROGRESS

  • Ph.D. (2)

    • Tajbakhsh, Saeid.
    • Theiri, Mariem. Développement de technologies innovatrices de détoxification des préhydrolysats de bois par voies biotechnologiques.
  • Master (thesis) (1)

    • Montégut, Léa.
  • Undergraduate (1)

    • Mameri, Kahina.

COMPLETED

  • Ph.D. Thesis (11)

    • Murschel, F. (2017). Développement de stratégies d'immobilisation du facteur de croissance endothélial vasculaire : contrôle de l'activité biologique pour le génie tissulaire (Ph.D. Thesis, École Polytechnique de Montréal). Retrieved from http://publications.polymtl.ca/2625/
    • Ren, X. (2017). A Dynamic Metabolomic Study of Lipid Production in Chlorella Protothecoides (Ph.D. Thesis, École Polytechnique de Montréal). Retrieved from http://publications.polymtl.ca/2582/
    • Zhao, X. (2017). Metabolomics and Dynamic Metabolic Flux Analysis in ABE (Acetone-Butanol-Ethanol) Fermentation (Ph.D. Thesis, École Polytechnique de Montréal). Retrieved from http://publications.polymtl.ca/2700/
    • Ghorbaniaghdam, A. (2013). Development of a Dynamic Model to Describe CHO cells Metabolic Network and Regulation (Ph.D. Thesis, École Polytechnique de Montréal). Retrieved from http://publications.polymtl.ca/1228
    • Sheikholeslami, Z. (2013). Comprehensive Characterization of an Inducible Mammalian Expression System Using 13C-Metabolic Flux Analysis (Ph.D. Thesis, École Polytechnique de Montréal). Retrieved from http://publications.polymtl.ca/1261
    • Hammami, I. (2011). Étude métabolique des cellules myéloïdes suppressives dans le contexte du phénomène d'immunosuppression (Ph.D. Thesis, École Polytechnique de Montréal). Retrieved from http://publications.polymtl.ca/584
    • Boivin, É. (2010). Optimisation de la production de protéines recombinantes avec des cellules de tabac en suspension (Ph.D. Thesis, École Polytechnique de Montréal). Retrieved from http://publications.polymtl.ca/263
    • Boucher, C. (2010). Immobilisation orientée du facteur de croissance de l'épiderme à des fins d'application en ingénierie tissulaire (Ph.D. Thesis, École Polytechnique de Montréal). Retrieved from http://publications.polymtl.ca/259
    • Cloutier, M. (2008). Modélisation cinétique du métabolisme des cellules végétales pour des fins de commande et d'optimisation en biorécateur (Ph.D. Thesis, École Polytechnique de Montréal).
    • Gigout, A. (2008). Optimisation et caractérisation de la culture de chondrocytes en suspension (Ph.D. Thesis, École Polytechnique de Montréal).
    • Lamboursain, L. (2004). Étude des liens entre le statut nutritionnel des cellules de plante et leur capacité à produire des métabolites secondaires (Ph.D. Thesis, École Polytechnique de Montréal).
  • Master's Thesis (28)

    • Kasbi, M. (2017). Étude de l'ajout d'acétate de sodium dans une culture de clostridium acétobutylicum ATCC 824 face à la production de riboflavine et butanol en bioréacteur cuvée (Master's Thesis, École Polytechnique de Montréal). Retrieved from http://publications.polymtl.ca/2730/
    • Laflaquiere, B. (2017). Mise en évidence de biomarqueurs des cellules souches de la gelée de Wharton par modélisation dynamique des flux métaboliques : l'impact du vieillissement cellulaire (Master's Thesis, École Polytechnique de Montréal). Retrieved from http://publications.polymtl.ca/2694/
    • Turmo, A. (2016). Planification expérimentale dans la modélisation métabolique des cellules CHO (Master's Thesis, École Polytechnique de Montréal). Retrieved from http://publications.polymtl.ca/2246/
    • Arnold, E. (2015). Surexpression de la glucose-6-phosphate déshydrogénase pour l'étude du métabolisme primaire de cellules de mammifères en mode cuvée (Master's Thesis, École Polytechnique de Montréal). Retrieved from http://publications.polymtl.ca/1851/
    • Robitaille, J. (2015). Modélisation dynamique de cultures de cellules CHO produisant un anticorps monoclonal en mode cuvée-alimentée (Master's Thesis, École Polytechnique de Montréal). Retrieved from http://publications.polymtl.ca/1714/
    • Chegini, S. (2014). Removal of Potential Inhibitors from Hemicellulose Hydrolysate by Membrane Filtration (Master's Thesis, École Polytechnique de Montréal). Retrieved from http://publications.polymtl.ca/1495
    • Binan, L. (2013). Fabrication par électrofilage d'une structure à élution de facteurs de croissance pour contrôler la différenciation de cellules souches neuronales en neurones moteurs (Master's Thesis, École Polytechnique de Montréal). Retrieved from http://publications.polymtl.ca/1181
    • Poliquin, P.O. (2012). Modélisation métabolique pour l'étude des voies de régulation énergétiques : un enjeu dans la maladie de Parkinson (Master's Thesis, École Polytechnique de Montréal). Retrieved from http://publications.polymtl.ca/1057
    • Torres, C.P. (2012). Étude du comportement de cellules endothéliales de l'aorte cultivées sur des fibres électrofilées de PET sous conditions physiologiques de cisaillement (Master's Thesis, École Polytechnique de Montréal). Retrieved from http://publications.polymtl.ca/959
    • Valancin, A. (2012). Étude de l'effet de la sous-expression de l'enzyme triosephosphate isomérase cytosolique sur le métabolisme de cellules de pomme de terre à l'aide d'un modèle métabolique cinétique (Master's Thesis, École Polytechnique de Montréal). Retrieved from http://publications.polymtl.ca/887
    • Valenti, M. (2012). Study of the Hemocompatibility of Non-Woven Sub-Microfibrous Structures of Polyethylene Terephthalate (PET): Effect of Sub-Microfibres Diameter and Alignment (Master's Thesis, École Polytechnique de Montréal). Retrieved from http://publications.polymtl.ca/1036
    • Heslouis, A. (2009). Purification par chromatographie en lit expansé de protéines recombinantes produites par cellules de tabac (Master's Thesis, École Polytechnique de Montréal).
    • Meneses Ramírez, E.A. (2008). Study of recombinant protein production from transgenic Nicotiana tabacum plant cells in a perfusion bioreactor (Master's Thesis, École Polytechnique de Montréal).
    • Ben-Tchavtchavadze, M.S. (2007). Conception d'un bioréacteur à petite échelle pour la culture de cellules mammifères en suspension en RMN in vivo (Master's Thesis, École Polytechnique de Montréal).
    • Chavane, N. (2007). Suivi en ligne de la production de protéines recombinantes en bioréacteur par résonance plasmonique de surface (Master's Thesis, École Polytechnique de Montréal).
    • Poulin, F. (2007). Étude des interactions entre les cellules HEK-293 et un adsorbant IMAC dans une colonne à lit en expansion (Master's Thesis, École Polytechnique de Montréal).
    • McMurray-Beaulieu, V. (2006). Étude du métabolisme énergétique des cellules mammifères cho à titre d'indicateur de croissance et de productivité (Master's Thesis, École Polytechnique de Montréal).
    • Chen, J. (2004). In vivo 31P-NMR study of phosphate metabolism for Eschscholtzia californica using a small-scale perfused bioreactor (Master's Thesis, École Polytechnique de Montréal).
    • De Dobbeleer, C. (2004). Développement d'un bioréacteur à perfusion pour les cellules végétales en suspension (Master's Thesis, École Polytechnique de Montréal).
    • Dupla, M. (2004). Optimisation hydrodynamique et choix du support bactérien d'un bioréacteur à lit mobile pour la dénitrification de l'eau de mer au biodôme de Montréal (Master's Thesis, École Polytechnique de Montréal).
    • Gmati, D. (2004). Développement d'un bioréacteur de petite échelle pour des mesures de RMN in vivo (Master's Thesis, École Polytechnique de Montréal).
    • Hisiger, S. (2004). Étude des moyens de modulation et suivi en continu par fluorescence du métabolisme cellulaire (Master's Thesis, École Polytechnique de Montréal).
    • Klvana, M. (2004). Étude de la stratégie d'extraction in-situ sur la production de métabolites secondaires dans des cultures de cellules végétales (Master's Thesis, École Polytechnique de Montréal).
    • Labelle, M.-A. (2004). Optimisation d'un bioprocédé de dénitrification d'un système aquacole marin en circuit fermé au Biodôme de Montréal (Master's Thesis, École Polytechnique de Montréal).
    • Leduc, M. (2004). Développement d'un modèle biocinétique du métabolisme primaire de catharanthus roseus (Master's Thesis, École Polytechnique de Montréal).
    • Tikhomiroff, C. (2001). Étude des métabolismes primaire et secondaire de racines transformées de catharanthus roseus en vue du développement d'un modèle cinétique (Master's Thesis, École Polytechnique de Montréal).
    • Bouchard-Marchand, E. (2000). Études biocinétiques et nutritionnelles de racines transformées de carotte en culture In Vitro (Master's Thesis, École Polytechnique de Montréal).
    • Boudreau, M.-J. (2000). Développement d'un bioréacteur à garnissages pour la culture de racines transformées (Master's Thesis, École Polytechnique de Montréal).

Press review about Mario Jolicoeur

May 5, 2017, Le Devoir, Un docteur pas ordinaire Mention de Mario Jolicoeur, professeur titulaire au Département de génie chimique de Polytechnique Montréal.