Cohen-Adad, Julien

Mon laboratoire développe des méthodes de pointe en Imagerie par Résonance Magnétique (IRM) pour évaluer la structure et la fonction du cerveau et de la moelle épinière. Les projets impliquent des développements méthodologiques tels que construction d'antennes, traitement d'image (correction de mouvement, segmentation, recalage multimodal). Un fort accent est mis sur la l'application clinique des développements, visant à améliorer le diagnostic et le pronostic chez les patients atteints de maladies neurodégénératives et traumatismes.

L'environnement du laboratoire est très multi-disciplinaire. Nous interagissons régulièrement avec des physiciens, ingénieurs, radiologues, neurologues et neurophysiologistes. En plus, notre laboratoire collabore avec le Martinos Center for Biomedical Imaging (Harvard), par conséquent certains projets impliqueront des déplacements à Boston. Les projets comprennent:

IRM de la moelle épinière chez des patients atteints de sclérose en plaques (collaboration avec Harvard),
Etudier des caractéristiques du cerveau par IRM à ultra-haut champ (collaboration avec Harvard),
Développement de méthodes basées deep learning pour analyser les images médicales (collaboration avec Mila),
Développement de logiciels open-source d'analyses d'images médicales
Construction d'antennes IRM

Affiliation(s)

Chaire de recherche du Canada de niveau 2 en imagerie par résonance magnétique quantitative, Titulaire
Laboratoire de Recherche en Neuroimagerie (NeuroPoly), Co-directeur
Unité de neuroimagerie fonctionnelle (UNF), Co-directeur
Centre de recherche du CHU Sainte-Justine, Université de Montréal, Montreal, QC, Canada, Chercheur
Centre de recherche de l'Institut universitaire de gériatrie de Montréal (CRIUGM), Chercheur
Département de neurosciences, Université de Montréal, Professeur associé
Centre de recherche en sciences et technologies biomédicales (GRSTB), Membre
Institut de valorisation des données (IVADO), Membre
Réseau de bio-imagerie du Québec (RBIQ), Membre
Institut de génie biomédical, Membre
Centre de recherche avancée en micro-ondes et en électronique spatiale (POLY-GRAMES), Membre
Mila - Quebec AI Institute, Montreal, QC, Canada, Membre associé

Type(s) d'expertises (sujets CRSNG)

1900 GÉNIE BIOMÉDICAL
1901 Technologie biomédicale
6400 RECHERCHE EN SCIENCES DE LA VIE LIÉES À LA SANTÉ PUBLIQUE ET AUX MALADIES HUMAINES
9000 SCIENCES MÉDICALES
2708 Traitement d'images et traitement vidéo
2605 Analyse de formes et intelligence artificielle
2603 Vision artificielle
2705 Logiciels et développement
3115 Physique médicale

Publications

Publications récentes

Valošek, J., Bédard, S., Keřkovský, M., Rohan, T., & Cohen-Adad, J. (2024). A database of the healthy human spinal cord morphometry in the PAM50 template space. Imaging Neuroscience, 2, 15 pages.

Schilling, K. G., Combes, A. J. E., Ramadass, K., Rheault, F., Sweeney, G., Prock, L., Sriram, S., Cohen-Adad, J., Gore, J. C., Landman, B. A., Smith, S. A., & O'Grady, K. P. (2024). Influence of preprocessing, distortion correction and cardiac triggering on the quality of diffusion MR images of spinal cord. Magnetic Resonance Imaging, 108, 11-21.

Valošek, J., & Cohen-Adad, J. (2024). Reproducible Spinal Cord Quantitative MRI Analysis with the Spinal Cord Toolbox. Magnetic Resonance in Medical Sciences, rev.2023-0 (9 pages).

Tsagkas, C., Hatipoglu, O., Ocampo-Pineda, M., Melie-Garcia, L., Weigel, M., Barakovic, M., Po-Jui, L., Cohen-Adad, J., Kappos, L., Kuhle, J., & Granziera, C. (février 2023). Advanced Quantitative MRI of Cervical Cord Pathology in Multiple Sclerosis Patients [Affiche]. 8th annual Americas Committee for Treatment and Research in Multiple Sclerosis (ACTRIMS 2023), San Diego, CA, USA. Publié dans Multiple Sclerosis Journal, 29(2 suppl).

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Biographie

Prof. Cohen-Adad est un physicien en IRM et développeur de logiciels avec plus de 15 ans d'expérience dans des méthodes avancées d'IRM pour l'évaluation quantitative de la structure et de la fonction du cerveau et de la moelle épinière. Il est professeur associé à Polytechnique Montréal, professeur adjoint de neurosciences à l'Université de Montréal, directeur adjoint de l'Unité Fonctionnelle de Neuroimagerie (Univ. Montréal), membre de Mila (Univ. Montréal) et il détient la Chaire de recherche du Canada en Imagerie par Résonance Magnétique Quantitative. Avec ses collègues Prof. Nikola Stikov, Prof. Alonso-Ortiz et Prof. De Leener, il co-dirige le Laboratoire NeuroPoly (www.neuro.polymtl.ca), qui comprend environ 30 étudiants diplômés et associés de recherche. Les recherches du Prof. Cohen-Adad sont très citées (Google Scholar). En tant que leader dans le domaine, il a organisé de multiples ateliers lors de conférences internationales (https://spinalcordmri.org/workshops.html). Il est un conférencier invité fréquent sur les méthodes avancées d'IRM et il sert régulièrement de consultant pour diverses entreprises (par exemple Biospective Inc., NeuroRx, IMEKA) et académiques (Harvard, U. Toronto, UCL, UCSF, etc.) pour la mise en place de protocoles d'acquisition d'IRM et de traitement d'images.

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Enseignement

GBM6125 : Bases du génie biomédical
GBM6904 : Séminaires de génie biomédical
GBM8378 : Principes d'imagerie biomédicale

Encadrement à Polytechnique

TERMINÉ

Thèse de doctorat (6)
- Enguix Chiral, V. (2022). Neonatal Resting-State Functional Magnetic Resonance Imaging: Optimization of Data Acquisition and Democratization of Data Preprocessing [Thèse de doctorat, Polytechnique Montréal].
- Mangeat, G. (2021). Development of in-Vivo Histology with Quantitative Magnetic Resonance Imaging to Resolve Fine Neurodegenerative Features [Thèse de doctorat, Polytechnique Montréal].
- Topfer, R. (2021). Local Coils and Prospective Shimming for MRI of the Spinal Cord [Thèse de doctorat, Polytechnique Montréal].
- De Leener, B. (2017). Development of an MRI Template and Analysis Pipeline for the Spinal Cord and Application in Patients with Spinal Cord Injury [Thèse de doctorat, École Polytechnique de Montréal].
- Duval, T. (2017). Quantification de la microstructure de la moelle épinière humaine par IRM et application chez des patients avec sclérose en plaques [Thèse de doctorat, École Polytechnique de Montréal].
- Lopez Rios, N. (2017). Development of a New Multi-Channel MRI Coil Optimized for Brain Studies in Human Neonates [Thèse de doctorat, École Polytechnique de Montréal].
Mémoire de maîtrise (17)
- Bourget, M.-H. (2022). Écosystème logiciel de segmentation de neurones sur des images microscopiques par apprentissage profond [Mémoire de maîtrise, Polytechnique Montréal].
- Cereza, G. (2022). Development of an Innovative Solution Minimizing RF Field Inhomogeneity and Energy Deposition in Ultra-High Field MRI Applications [Mémoire de maîtrise, Polytechnique Montréal].
- D'Astous, A. (2022). Shimming Toolbox: An Open-Source Software Package for Shimming the B0 and B1 Field in Magnetic Resonance Imaging [Mémoire de maîtrise, Polytechnique Montréal].
- Lemay, A. (2022). Impact of Soft Segmentation Training on Medical Image Segmentation and Uncertainty Representation [Mémoire de maîtrise, Polytechnique Montréal].
- Vincent, O. (2021). Impact of Rater Style on Deep Learning Segmentation in Medical Imaging [Mémoire de maîtrise, Polytechnique Montréal].
- Rouhier, L. (2020). Prognosis for Degenerative Cervical Myelopathy: A Computer Learning Approach on the AOspine Database [Mémoire de maîtrise, Polytechnique Montréal].
- Nami, H. (2019). Clustering of the White Matter Tracts in the Rat Spinal Cord Based on Quantitative Histology [Mémoire de maîtrise, Polytechnique Montréal].
- Samuel Perone, C. (2019). Deep Learning Methods for MRI Spinal Cord Gray Matter Segmentation [Mémoire de maîtrise, Polytechnique Montréal].
- Gros, C. (2018). Automatic Segmentation of Intramedullary Multiple Sclerosis Lesions [Mémoire de maîtrise, École Polytechnique de Montréal].
- Zaimi, A. (2018). Automatic Axon and Myelin Segmentation of Microscopy Images and Morphometrics Extraction [Mémoire de maîtrise, École Polytechnique de Montréal].
- Germain, G. (2017). Une antenne hybride RF/shimming pour l'IRM de la moelle épinière [Mémoire de maîtrise, École Polytechnique de Montréal].
- Saliani, A. (2017). Construction d'un atlas de la microstructure de la matière blanche de la moelle épinière chez le rat à partir d'acquisitions histologiques [Mémoire de maîtrise, École Polytechnique de Montréal].
- Vuong, M. T. (2017). Comparison of Myelin Imaging Techniques in Ex Vivo Spinal Cord [Mémoire de maîtrise, École Polytechnique de Montréal].
- Lévy, S. (2016). Caractérisation de la microstructure des voies spinales humaines par IRM multiparamétrique [Mémoire de maîtrise, École Polytechnique de Montréal].
- Mangeat, G. (2016). Study of Human Cortical Microstructure Using Magnetization Transfer and T2* Mapping with Application in Multiple Sclerosis [Mémoire de maîtrise, École Polytechnique de Montréal].
- Foias, A. (2015). Design and Construction of a Highly Sensitive Coil for MRI of the Spinal Cord [Mémoire de maîtrise, École Polytechnique de Montréal].
- De Leener, B. (2014). Segmentation automatique de la moelle épinière sur des images de résonance magnétique par propagation de modèles déformables [Mémoire de maîtrise, École Polytechnique de Montréal].

Nouvelle(s) concernant Julien Cohen-Adad

NOUVELLES | 10 février 2022

Un appui du Québec et de l'Allemagne pour le développement d’un outil d’IA ciblant la sclérose en plaques | Lire

NOUVELLES | 6 janvier 2022

Découverte «Québec Science» de l’année 2021: les professeurs Cohen-Adad et Gervais et leurs équipes parmi les finalistes | Lire

BLOGUE | 31 août 2021

Pas de géant en imagerie de la moelle épinière | Lire

NOUVELLES | 22 juin 2021

Programme des chaires de recherche du Canada : renouvellement d’une chaire détenue par le professeur Julien Cohen-Adad à Polytechnique Montréal | Lire

NOUVELLES | 22 juin 2021

Sciences humaines : des chercheuses et des chercheurs de Polytechnique Montréal impliqués dans des projets et partenariats de recherche | Lire

NOUVELLES | 29 avril 2021

Polytechnique Montréal récompense la meilleure thèse et le meilleur mémoire de l’année 2020 | Lire

NOUVELLES | 24 février 2021

50 scientifiques de Polytechnique Montréal parmi le top 2 % des plus cités dans leur champ de recherche | Lire

NOUVELLES | 1 juin 2018

Promotions du corps professoral 2018 à Polytechnique Montréal | Lire

NOUVELLES | 22 janvier 2018

Concours de projets 2017 de l’Institut TransMedTech : du soutien pour les projets de professeurs et d’étudiants chercheurs de Polytechnique Montréal | Lire

NOUVELLES | 12 février 2016

Polytechnique reçoit 7,5 M$ pour six chaires dans le cadre du Programme des chaires de recherche du Canada | Lire

NOUVELLES | 21 juillet 2015

Un chercheur de Polytechnique récipiendaire d'une subvention du nouveau volet Fondation des IRSC | Lire

INNOVATIO | 9 mars 2015

Dévoiler les secrets du système nerveux central avec les nouvelles technologies IRM | Lire

Revue de presse concernant Julien Cohen-Adad

23 janvier 2022, Québec Science, Un nouveau protocole qui promet de changer le monde médical Une équipe de 92 personnes, menée par le Pr Julien Cohen-Adad du Département de génie électrique de Polytechnique Montréal, a mis au point un protocole permettant de créer des images par résonance magnétique de la moelle épinière plus claires et plus justes qu’auparavant.

1 janvier 2022, Québec Science, Moelle épinière : nouveau souffle pour les IRM Jusqu’à tout récemment, les images de la moelle épinière obtenues par résonance magnétique n’étaient pas standardisées, ce qui empêchait de les comparer et de suivre l’évolution des lésions. C’est maintenant réglé grâce à une avancée du Pr Julien Cohen-Adad du Département de génie électrique sélectionnée parmi les 10 Découvertes de l’année par le magazine Québec Science.

8 février 2016, Le Devoir, Les capacités d'apprentissage du système nerveux Image obtenue par résonance magnétique des faisceaux de fibres nerveuses (ou axones) qui descendent dans la moelle épinière et dont les corps cellulaires sont situés dans le cortex cérébral. ( Photo: Laboratoire du professeur Julien Cohen-Adad, École Polytechnique de Montréal).

Répertoire des expertises